A mudança mais notória é a nova interface, planejada, de acordo com a empresa, para oferecer navegação mais simples. As ferramentas principais do sistema aparecem logo na tela inicial. Além disso, haverá também uma versão para dispositivos que não tenham tela sensível ao toque.
Outro destaque é a loja virtual chamada de Windows Marketplace for Mobile, que permite ao usuário buscar e comprar aplicativos para seu smartphone. Os desenvolvedores que já criaram softwares também poderão oferecê-los, mas antes será necessário que a Microsoft faça testes de segurança e compatibilidade.
Visando a melhorar a navegação na web, o sistema é baseado no Internet Explorer 6 e terá suporte a Flash e JavaScript, além de outras ferramentas para facilitar a visualização da página, como uma barra na lateral direita da tela para uso do zoom.
O sistema virá também com o serviço My Phone, através do qual as informações do telefone (como mensagens, contatos e fotos) são sincronizadas com um site da Microsoft. Caso o aparelho seja perdido ou roubado, ou mesmo substituído por um modelo mais recente, o usuário conseguiria restaurar os dados.
Os primeiros aparelhos equipados com Windows Mobile 6.5 devem chegar ao mercado no fim deste ano. A LG deve lançar um aparelho equipado com o sistema, e a HTC oferecerá a atualização para alguns de seus smartphones.